米奇妙妙屋第三季喜爱植物的11岁小女孩莫莉（陈思诺 饰），和植物学家爸爸（王千源 饰）带回家的机器人阿鲁一起长大。爸爸意外失踪，莫莉在妈妈叶霖（蒋勤勤 饰）的鼓励下，决定和阿鲁一起找回爸爸，而她要面对的成长挑战才刚刚开始……