日本沉没电影本剧讲述了东京发生骇人听闻的连续杀人案，新闻节目导演筒井万琴（岸井雪乃 饰）在采访时邂逅了神秘记者设乐浩晖（志尊淳 饰）。浩晖率先报道案件，并将其命名为“荷鲁斯之眼杀人事件”。受害者皆为女性，公司职员，每月特定日期被残忍杀害，双眼戴上不同颜色的隐形眼镜。万琴与浩晖立场相悖，却在调查中渐生情愫。然而，这场相遇却是通往黑暗的入口。浩晖究竟是揭露真相的记者，还是隐藏在暗处的连环杀手？一场信任与怀疑交织的禁忌之恋就此展开。