神奇宝贝天空之阿空生物学家胡朔为救基因缺陷的儿子，研究用蚂蚁基因改善人类基因，却遭所有人否定，妻子刘幸之也离他而去。黄锦雄因病资助研究，参观实验室时蚁后逃走变异，带领蚁群攻击众人，胡朔和黄锦雄身体也开始蚁化。最终，刘幸之封锁引爆实验室，阻止了浩劫。