工作细胞第二季一队FBI新兵，每个人都有自己特殊的加入理由，他们在弗吉尼亚Quantico努力通过训练。故事在他们过去的隐藏历史和现在的训练之间切换，还将闪现他们不远的将来的片段，其中一个新兵竟然是潜伏的恐怖分子，对911以来美国最大的恐怖袭击负责。