电影蓝色档案本剧改编自同名韩剧。居住在羽多野町的女大学生富樫琴音，在自家庭院里仅留下了一截手指第一关节后神秘失踪，案件至今未解，转眼已过去25年。她的孪生哥哥富樫浩之（安田显 饰）如今成为了一名警察，任职于羽多野署生活安全科。这时，一位精英警官八代真人（水上恒司 饰）被调任至此。两人性格不合，却在科长森平的命令下被迫搭档。某日，在巡逻途中，他们接到报警前往搜寻一位失智老人，然而事件却由此展开…