巨蟒大战恐鳄讲述了宁真童年时期目睹父亲遇害现场，母亲离奇失踪，刑警队长陆征为查清真相惨遭杀害，现场留下的神秘符号“深渊”，将宁真、陆征的女儿陆凡和徒弟曹进几人的命运紧密相连，多年后，“深渊”再现，连环命案，迷雾重重，仿佛陷入无法逃脱的宿命的故事。