眼镜蛇部队的崛起故事讲述了民国时期的重庆，留洋归来的纨绔少爷樊仁礼，意外卷入了一场离奇的凶杀案中，他在寻找案件真相的过程中结识新任女探长李剑秋，一对欢喜冤家历经了一系列不同寻常的危险事件，在逐步抽丝剥茧，即将揭开事件谜团之时，却惊奇地发现这起连环杀人案的背后，牵涉了多年前秘密组织蓝衣社中的一段恩怨过往。