名侦探柯南剧场版迷宫的十字路口讲述了一位痴迷于村山画作的年轻女子阿咲，一位能听到不寻常频率并自称是村山或其精神印记的年轻男子佐久，以及一组具有超能力的年轻表演者。他们因村山的作品而结缘，并在前往一个名为“阿加尔塔”的神秘洞穴的旅途中，通过表演舞蹈重现他的作品。