忍者神龟:变种时代张勇因保护监测浮标而不幸失去妻子，自此一蹶不振，退出海洋监测队，靠打渔养活女儿。多年后，一场台风，他与老站长再次相遇，并发现了一宗海洋污染事件。在老站长的带领下，一群人深入神秘的海蛇岛，寻找海洋污染的秘密，却不知道岛上危机四伏，比巨蛇更可怕的竟是人心！一群人不畏生死，最终守护了海洋生物栖息地的安宁。而张勇也在这次行动中，终于放下过往，走出阴霾，重新担任起守护海洋的职责。