被遗弃的秘密故事发生在父亲邱领邦 (郑少秋) ，其妻因难产而死，留下一子邱南生 (周世英) ，　　故父甚疼爱，父子感情融洽。领邦英俊倜傥，很多少女对之仰慕，奈何他无意续弦，引来不少风流韵事。领邦家里有个诸事丁管家婆 (苏杏璇) ，她样样都管，经常催促领邦结婚，闹出很多趣事。在公司里，领邦碰上三个很「怪」的职员，各有各的个性，令领邦碰到很多「翳气」的事情。南生虽年纪细小，但已懂得很多事，欢喜时助领邦一臂之力，不高兴时则破坏之，常弄得父亲啼笑皆非。