幽灵行动阿尔法完整版裏稼業で働く孤独なヤクザの辰巳は、ある日元恋人・京子の殺害現場に遭遇する。 一緒にいた京子の妹・葵とともに命からがら逃げる辰巳だったが、最愛の家族を失い、復讐を誓う葵は京子殺害の犯人を追う。 葵に振り回されながらも彼女を助ける辰巳は事件の真相に迫っていくのだが...