一代枭雄三支旗故事主要讲述了东北山村穷小子项云峰为治疗奶奶的病情，改善自己的生活和命运，被迫于21世纪初加入北方偷盗文物的团伙，历经南北，遍历江湖，见识三教九流，从青涩少年成长为中年男子、遭遇无数奇人异事，最后从善如流、惩恶扬善的完成人生蜕变的故事。