非常小特工天手让叶是名女高中生，在空中的宇宙殖民卫星过着平静的生活。　　但在遇到难民少女尼娅安后，她被卷入了非法MS决斗竞技“军团战”之中。她化名“玛秋”参赛，驾驶着GQuuuuuuX，每日投身激烈的战斗。　　同时，被宇宙军和警察两方追捕的神秘MS“高达”及其驾驶员──少年修司，出现在她们面前。　　接着，世界迎向了新时代。