王牌特工：特工学院本剧讲述的是因事故而死别的夫妇被“1天只能在房间里重逢3分钟”的奇迹所折腾的故事。在广告制作公司工作的并川干太（伊野尾慧 饰）和妻子夏目（伊原六花 饰）结婚3年后，夏目对干太的过度溺爱感到不满。有天干太发现了夏目出轨的证据，犹豫着想要追问，她却因事故去世了。但是夏目突然出现在房间里，惊讶地说着“诶？ ！为什么干太还活着？ ！”以“丈夫因事故死亡的世界”和“妻子因事故死亡的世界”这两个世界为舞台，互相追逐死亡之谜的爱情悬疑故事。